• Шипунов А.Б., Балдин Е.М. и др. Наглядная статистика. Используем R!
• Мастицкий С.Э., Шитиков В.К., Статистический анализ и визуализация с помощью R
• Мастицкий С.Э., Шитиков В.К., Классификация, регрессия, data-mining в R
• Василенко Є.С, Обробка геологiчної iнформацiї з використанням програмного середовища R
• Кабаков Р.И. R в действии. Анализ и визуализация данных на языке R

• Стилевое руководство гугла: english, русский
• Блог r-analytics. В блоге есть несколько других подборок русскоязычных ресурсов по R: раз и два.
• Группа вконтакте rstatistics
• Группа вконтакте spbrug
• Группа вконтакте introstats
• Венэбльз, Смит Введение в R
• Зарядов И.С. Введение в R: часть 1
• Зарядов И.С. Введение в R: часть 2
• Борис Демешев Цикл маленьких заметок по R

• Основы программирования на R от stepik.org

• Анализ данных в R от stepik.org

Английских источников гораздо больше :)

• Trevor Hastie, Robert Tibshirani, An Introduction to Statistical Learning. По книжке есть курс на платформе class.standford.edu

• Rob Hyndman, Forecasting: principles and practice Книжка по временным рядам от безбожника и автора пакета forecast Роба Хиндмана :)

• Garrett Grolemund, Hadley Wickham, R for Data Science

• Colin Gillespie, Robin Lovelace, Efficient R programming, он-лайн книга для более продвинутых пользователей R. Написана на R и markdown :)

• Rob Kabacoff, Quick R

• Farnsworth, Econometrics in R

• Cookbook for R

• R-inferno Адский учебник по R с картинками Ботичелли, "Even if it doesn't help you with your problem, it might amuse you"

• Roger Peng, R programming for data science и на bookdown

• Introduction to R, Введение с официального сайта

• Документация по графикам ggplot2

• Документация к R от stats.stackexchange

• Шикарные шпаргалки от Rstudio

• Агрегатор блогов r-bloggers

• Поисковик он-лайн курсов по R

• Try R Путь к сокровищам R для самых начинающих пиRатов!

• datacamp.com Несколько платных и бесплатных интерактивных курсов по R

• 100 курсов и книг по R от разных университетов
• Удачные пакеты

• Поисковик rdrr.io

• stackoverflow Если возникли проблемы с программированием в R (и не только в R), а документация уже прочитана...

• stats.stackexchange Можно спросить по статистическим методам и их реализации в R.

• tex.stackexchange Вопросы и ответы про LaTeX

Предложить свой источник можно через pull-request или комментарий

Ура :)