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  • From Shapefile to GeoJSON

    4 users

    vallandingham.me

    UPDATE - Feb 11, 2015 This is an old post, and needed some love. I’ve updated it a bit with the following changes: New github repo - for the D3 visualization part at the end Automatically determines the projection’s scale and translation (from a Bostock Example ) - so this should work easier for any geojson file generated. JavaScript as well as CoffeeScript implementations for the D3 part. Hope th

    • テクノロジー
    • 2012/06/17 00:28
    • GeoJSON
    • RNA-seq: Finding Differentially Expressed Genes

      3 users

      vallandingham.me

      Here are some notes on processing RNA-seq data to find differentially expressed genes. A much abbreviated version of this pipeline comes from Cufflink’s Tutorial Page The extended version given below follows the more exploratory pattern of someone who hasn’t done much (any) NGS data analysis before. Tools Used TopHat v1.1.2 Cufflinks v1.0.1 Samtools v0.1.16 Requirements Sequence Files We are start

      • 世の中
      • 2011/10/30 17:46

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